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β淀粉酶在食品工业中用作糖化剂，用于生产麦芽糖浆、啤酒、面包等。在制药工业中，β淀粉酶的重要用途是生产麦芽糖。麦芽糖的吸收并不取决于胰岛索，因此即使是糖尿病患者也可以食用适量的食物。在医学上，β淀粉酶也可以与α-淀粉酶一起用作消化助剂。当它与脱支酶一起起作用时，它可使淀粉几乎完全水解。与α淀粉酶和脱支酶一起，可以生产高麦芽糖浆（含麦芽糖G，占65％）和更高麦芽糖浆（含麦芽糖，占83％）。
1、麦芽糖的生产
近年来，使用微生物（如多粘芽孢杆菌和巨大芽孢杆菌）产生的β淀粉酶糖化液化淀粉原料可使焦糖的麦芽糖含量增加至60-70％。该产品称为高麦芽糖浆（通常由大麦糖化淀粉制成，其麦芽糖含量仅为30-40％，其余为糊精等），适用于生产硬糖。
如果该酶与异淀粉酶结合使用。麦芽糖的产率为约95％。将该糖浆浓缩至80％的浓度，冷却至35℃，并且将结晶的麦芽糖用作晶种。可以通过冷却和结晶获得结晶的麦芽糖。结晶麦芽糖经氢化处理后制成麦芽糖醇。它的甜度接近蔗糖，并且具有很强的耐热性。在高温下它不会变色和分解，从而打开了应用领域。
2、在食物中的作用
烘烤：加速发酵。改善面包粉，增加面包体积，改善肤色和面包屑结构。
淀粉液化：减少麦芽糖，如喷射液化用液体。
酒精饮料酿造：降低糖浆的粘度并将淀粉转化为糖进行发酵。
水果和蔬菜汁：去除淀粉可改善外观并提高提取率。大多数的果泥生产和肉软化使用液体。
